「高美濕地」擁有豐富的天然資源,曾有多達120餘種鳥類在此棲息,為十分重要的生態保育區,也是國內少數雁鴨集體繁殖區之一。
雖然面積不大,但由於泥質及沙質灘地兼具,加上與河口沼澤地帶鑲嵌在一起,所以孕育了豐富又複雜的濕地生態,以及目前所知全臺灣最大族群的雲林莞草區,形成乾濕相間伴有植物生長的複雜地形。